- 13年03月07日 Jmjd3 Inhibits Reprogramming by Upregulating Expression of INK4a/Arf and Targeting PHF20 for Ubiquitination
- 13年03月07日 Diabetes Risk Gene and Wnt Effector Tcf7l2/TCF4 Controls Hepatic Response to Perinatal and Adult Metabolic Demand
- 13年03月07日 Genome-Wide Quantitative Enhancer Activity Maps Identified by STARR-seq
- 13年03月07日 Dynamics of 5-hydroxymethylcytosine and chromatin marks in Mammalian neurogenesis
- 13年02月07日 MaxQuant enables high peptide identification rates, individualized p.p.b.-range mass accuracies and proteome-wide protein quantification
- 13年02月07日 STATs Shape the Active Enhancer Landscape of T Cell Populations
- 13年02月07日 Olig2 targets chromatin remodelers to enhancers to initiate oligodendrocyte differentiation
- 13年02月07日 Suppression of the antiviral response by an influenza histone mimic
- 13年01月17日 The COMPASS Subunit Spp1 Links Histone Methylation to Initiation of Meiotic Recombination
- 13年01月17日 Global changes in the nuclear positioning of genes and intra- and interdomain genomic interactions that orchestrate B cell fate.
- 13年01月16日 RNA Polymerase II Collision Interrupts Convergent Transcription
- 13年01月16日 The Deacetylase Sirt6 Activates the Acetyltransferase GCN5 and Suppresses Hepatic Gluconeogenesis
- 12年12月20日 Six2 and Wnt regulate self-renewal and commitment of nephron progenitors through shared gene regulatory networks
- 12年12月20日 Transcriptional amplification in tumor cells with elevated c-Myc
- 12年12月20日 The Histone H2B Monoubiquitination Regulatory Pathway Is Required for Differentiation of Multipotent Stem Cells
- 12年12月20日 Asymmetrically Modified Nucleosomes
- 12年11月22日 Gene Loops Enhance Transcriptional Directionality
- 12年11月22日 Prdm3 and Prdm16 are H3K9me1 Methyltransferases Required for Mammalian Heterochromatin Integrity
- 12年11月22日 The BAH domain of ORC1 links H4K20me2 to DNA replication licensing and Meier-Gorlin syndrome
- 12年11月22日 Facilitators and Impediments of the Pluripotency Reprogramming Factors' Initial Engagement with the Genome
- 12年10月18日 EZH2 inhibition as a therapeutic strategy for lymphoma with EZH2-activating mutations
- 12年10月18日 The long-range interaction landscape of gene promoters
- 12年10月18日 Brown Remodeling of White Adipose Tissue by SirT1-Dependent Deacetylation of Pparγ
- 12年10月18日 Loss of 5-Hydroxymethylcytosine Is an Epigenetic Hallmark of Melanoma
- 12年09月27日 ENCODE
- 12年09月27日 Transcript Dynamics of Proinflammatory Genes Revealed by Sequence Analysis of Subcellular RNA Fractions
- 12年07月12日 Essential role for miR-196a in brown adipogenesis of white fat progenitor cells
- 12年07月12日 PGC7 binds histone H3K9me2 to protect against conversion of 5mC to 5hmC in early embryos
- 12年07月12日 Methods for quantitative mapping of 5hmC in genomic DNA at single-base resolution
- 12年06月14日 The little elongation complex regulates small nuclear RNA transcription
- 12年06月14日 The SET8 H4K20 protein lysine methyltransferase has a long recognition sequence covering seven amino acid residues
- 12年06月14日 Reviews on PR-Set7
- 12年06月14日 Genetic inactivation of the polycomb repressive complex 2 in T cell acute lymphoblasticleukemia
- 12年05月17日 Chromatin-targeting small molecules cause class-specific transcriptional changes in pancreatic endocrine cells
- 12年05月17日 A Long ncRNA Links Copy Number Variation to a Polycomb / Trithorax Epigenetic Switch in FSHD Muscular Dystrophy
- 12年05月17日 Histone H3 Lysine 56 Methylation Regulates DNA Replication through Its Interaction with PCNA
- 12年04月12日 Systems biology meeting 2012
- 12年04月12日 Histone recognition and large-scale structural analysis of the humanbromodomain family.
- 12年04月12日 Nuclear Matrix Factor hnRNP U/SAF-A Exerts a Global Control of lternative Splicing by Regulating U2 snRNP Maturation
- 12年04月12日 Down-Regulation of Type I Runx2 Mediated by Dexamethasone Is Required for 3T3-L1 Adipogenesis
- 12年03月08日 IDH mutation impairs histone demethylation and results in a block to cell differentiation
- 12年03月08日 Chromatin-modifying enzymes as modulators of reprogramming
- 12年03月08日 IDH1 mutation is sufficient to establish the glioma hypermethylator phenotype
- 12年02月09日 DNA breaks and chromosome pulverization from errors in mitosis.
- 12年02月09日 Extensive Promoter-Centered Chromatin Interactions Provide a Topological Basis for Transcription Regulation
- 12年02月09日 The three-dimensional folding of the α-globin gene domain reveals formation of chromatin globules
- 12年01月12日 Uncovering the role of 5-hydroxymethylcytosine in the epigenome
- 12年01月12日 Single-stranded noncoding RNAs mediate local epigenetic alterations at gene promoters in rat cell lines.
- 12年01月12日 ATP-Citrate Lyase Links Cellular Metabolism to Histone Acetylation.
- 12年01月12日 Spatio-temporal transcriptome of the human brain
- 11年12月08日 Master Transcription Factors Determine Cell-Type-Specific Responses to TGF-β Signaling
- 11年12月08日 Sensitive and specific single-molecule sequencing of 5-hydroxymethylcytosine.
- 11年12月08日 Alternatively activated macrophages produce catecholamines to sustain adaptive thermogenesis.
- 11年11月17日 RNAi screen identifies Brd4 as a therapeutic target in acute myeloid leukaemia
- 11年11月17日 Inhibition of BET recruitment to chromatin as an effective treatment for MLL-fusion leukaemia.
- 11年11月17日 Identification of 67 Histone Marks and Histone Lysine Crotonylation as a New Type of Histone Modification
- 11年11月17日 ATRX ADD domain links an atypical histone methylation recognition mechanism to human mental-retardation syndrome
- 11年10月13日 CTCF-promoted RNA polymerase II pausing links DNA methylation to splicing
- 11年10月13日 Context-Specific Regulation of NF-κB Target Gene Expression by EZH2 In Breast Cancers
- 11年10月13日 PKA-dependent regulation of the histone lysine demethylase complex PHF2-ARID5B
- 11年10月13日 Integrative annotation of human large intergenic noncoding RNAs reveals global properties and specific subclasses
- 11年09月15日 lincRNAs act in the circuitry controlling pluripotency and differentiation
- 11年09月15日 Tet Proteins Can Convert 5-Methylcytosine to 5-Formylcytosine and 5-Carboxylcytosine
- 11年09月15日 Mir193b-365 is essential for brown fat differentiation
- 11年09月15日 Integrative Regulatory Mapping Indicates that the RNA-Binding Protein HuR Couples Pre-mRNA Processing and mRNA Stability. / Transcriptome-wide Analysis of Regulatory Interactions of the RNA-Binding Protein HuR.
- 11年07月20日 Inheritance of Stress-Induced, ATF-2-Dependent Epigenetic Change
- 11年07月20日 YY1 Tethers Xist RNA to the Inactive X Nucleation Center
- 11年07月20日 CTCF-mediated functional chromatin interactome in pluripotent cells
- 11年07月20日 Recognition of a mononucleosomal histone modification pattern by BPTF via multivalent interactions
- 11年06月23日 Biochemical Characterization of Human SET and MYND Domain-Containing Protein 2 Methyltransferase
- 11年06月23日 Pyruvate kinase M2 is a PHD3-stimulated coactivator for hypoxia-inducible factor 1
- 11年06月23日 Pluripotency Factors in Embryonic Stem Cells Regulate Differentiation into Germ Layers
- 11年05月26日 An Epigenetic Signature for Monoallelic Olfactory Receptor Expression
- 11年05月26日 TET1 and hydroxymethylcytosine in transcription and DNA methylation fidelity
- 11年05月26日 Class IIa Histone Deacetylases Are Hormone-Activated Regulators of FOXO and Mammalian Glucose Homeostasis
- 11年05月26日 A Rapid, Extensive, and Transient Transcriptional Response to Estrogen Signaling in Breast Cancer Cells
- 11年04月21日 No-nonsense Function for Long Noncoding RNAs
- 11年04月21日 The histone methyltransferase SETDB1 is recurrently amplified in melanoma and accelerates its onset
- 11年04月21日 Human papillomavirus E7 oncoprotein induces KDM6A and KDM6B histone demethylase expression and causes epigenetic reprogramming
- 11年04月21日 Enhancer function: new insights into the regulation of tissue-specific gene expression
- 11年01月13日 TRIM24 links a non-canonical histone signature to breast cancer
- 11年01月13日 Transcriptional activation of polycomb-repressed genes by ZRF1
- 11年01月13日 Siah2-Dependent Concerted Activity of HIF and FoxA2 Regulates Formation of Neuroendocrine Phenotype and Neuroendocrine Prostate Tumors
- 10年12月16日 Differentiation-Specific Histone Modifications Reveal Dynamic Chromatin Interactions and Partners for the Intestinal Transcription Factor CDX2
- 10年12月15日 Pausing of RNA Polymerase II Disrupts DNA-Specified Nucleosome Organization to Enable Precise Gene Regulation
- 10年12月15日 STAT6-mediated displacement of polycomb by trithorax complex establishes long-term maintenance of GATA3 expression in T helper type 2 cells
- 10年11月10日 Epigenetic Antagonism between Polycomb and SWI/SNF Complexes during Oncogenic Transformation
- 10年11月10日 Long Noncoding RNAs with Enhancer-like Function in Human Cells
- 10年11月10日 Chromatin regulation by Brg1 underlies heart muscle development and disease
- 10年10月20日 Quantitative interaction proteomics and genome-wide profiling of epigenetic histone marks and their readers.
- 10年10月20日 Mediator and cohesin connect gene expression and chromatin architecture.
- 10年10月20日 A Large Intergenic Noncoding RNA Induced by p53 Mediates Global Gene Repression in the p53 Response
- 10年10月20日 Structure of RCC1 chromatin factor bound to the nucleosome core particle
- 10年07月01日 Klf4 Interacts Directly with Oct4 and Sox2 to Promote
- 10年06月10日 Widespread transcription at neuronal activity-regulated enhancers
- 10年06月10日 Small silencing RNAs in plants are mobile and direct epigenetic modification in recipient cells.
- 10年06月10日 Transcriptome-wide identification of RNA-binding protein and microRNA target sites by PAR-CLIP.
- 10年06月10日 A functional link between the histone demethylase PHF8 and the transcription fa ctor ZNF711 in X-linked mental retardation.
- 10年05月21日 JMJD1a特集
- 10年04月28日 The Histone Chaperone Nap1 Promotes Nucleosome Assembly by Eliminating Nonnucleosomal Histone DNA Interactions
- 10年04月28日 GATA-dependent recruitment of MEF2 proteins to target promoters
- 10年04月28日 Long non-coding RNA HOTAIR reprograms chromatin state to promote cancer metastasis
- 10年04月14日 Histone H3K27 methyltransferase Ezh2 represses Wnt genes to facilitate adipogenesis
- 10年04月14日 A Chromatin-Mediated Reversible Drug-Tolerant State in Cancer Cell Subpopulations
- 10年04月14日 Structural Biology of Human H3K9 Methyltransferases
- 10年04月07日 An oncogene-tumor suppressor cascade drives metastatic prostate cancer by coordinately activating Ras and nuclear factor-kappaB.
- 10年04月07日 Hypoxic silencing of tumor suppressor RUNX3 by histone modification in gastric cancer cells.
- 10年04月07日 A map of open chromatin in human pancreatic islets.
- 10年04月07日 UTX mediates demethylation of H3K27me3 at muscle-specific genes during myogenesis.
- 10年02月09日 The histon deacetylase Sirt6 regulates glucose homeostasis via HIF1α.
- 10年01月28日 ショウジョウバエのゲノムワイド肥満遺伝子スクリーニングによってヘッジホッグシグナルが褐色脂肪細胞と白色脂肪細胞の運命を決定づけることを解明
- 10年01月28日 A Region of the Human HOXD Cluster that Confers Polycomb-Group Responsiveness
- 10年01月28日 Genome-wide analysis of PTB-RNA interactions reveals a strategy used by the general splicing repressor to modulate exon inclusion or skipping.
- 10年01月28日 Controlling Hematopoiesis through Sumoylation-Dependent Regulation of a GATA Factor
- 10年01月13日 Reprogramming towards pluripotency requires AID-dependent DNA demethylation
- 10年01月13日 Jumonji Modulates Polycomb Activity and Self-Renewal versus Differentiation of Stem Cells
- 10年01月13日 HnRNP proteins controlled by c-Myc deregulate pyruvate kinase mRNA splicing in cancer
- 09年11月25日 Intronic enhancers coordinate epithelial-specific looping of the active CFTR locus
- 09年11月25日 An RNA code for the FOX2 splicing regulator revealed by mapping RNA-protein interactions in stem cells.
- 09年11月25日 Dynamic Interactions and Cooperative Functions of PGC-1a and MED1 in TRa-Mediated Activation of the Brown-Fat-Specific UCP-1 Gene
- 09年11月04日 nter-MAR Association Contributes to Transcriptionally Active Looping Events in Human b-globin Gene Cluster
- 09年11月04日 The nuclear envelope and transcriptional control
- 09年11月04日 Regulation of the Histone Demethylase JMJD1A by HIF-1α Enhances Hypoxic Gene Expression and Tumor Growth.
- 09年10月21日 DNA demethylation in hormone-induced transcriptional derepression
- 09年10月21日 Nucleation, propagation and cleavage of target RNAs in Ago silencing complexes
- 09年10月21日 Regulation of Histone Acetylation in the Nucleus by Sphingosine-1-Phosphate
- 09年09月30日 Genome-wide Mapping of HATs and HDACs Reveals Distinct Functions in Active and Inactive Genes
- 09年09月30日 Protein methyltransferases as a target class for drug discovery
- 09年09月30日 Generation of an epigenetic signature by chronic hypoxia in prostate cells.
- 09年09月08日 Mass spectrometry identifies and quantifies 74 unique histone H4 isoforms in differentiating human embryonic stem cells
- 09年09月08日 Linking DNA methylation and histone modification: patterns and paradigms
- 09年08月25日 Drosophila MSL complex globally acetylates H4K16 on the male X chromosome for dosage compensation
- 09年08月25日 CTCF: Master Weaver of the Genome
- 09年08月25日 GPS2 is required for cholesterol efflux by triggering histone demethylation, LXR recruitment, and coregulator assembly at the ABCG1 locus.
- 09年08月25日 Clearing the way for mitosis: is cohesin a target?
- 09年08月25日 抗原受容体の多様性を生み出すクロマチン構造変化
- 09年07月14日 The Putative Tumor Suppressor microRNA-101 Modulates the Cancer Epigenome by Repressing the Polycomb Group Protein EZH2
- 09年07月14日 Polycomb Mediated Epigenetic Silencing and Replication Timing at the INK4a/ARF Locus during Senescence
- 09年07月14日 Polycomb protein Ezh2 regulates pancreatic β-cell Ink4a/Arf expression and regeneration in diabetes mellitus
- 09年07月01日 Nature:A spatial gradient coordinates cell size and mitotic entry in fission yeast.他
- 09年06月30日 インターフェロン誘導性のP200タンパクファミリー
- 09年06月30日 hnPNP and PCAF
- 09年06月30日 GlcNAcylation of a histone methyltransferase in retinoic-acid-induced granulopoiesis
- 09年06月11日 microRNAとhESC
- 09年06月10日 p16遺伝子領域でのCTCFの結合と遺伝子発現
- 09年06月10日 FoxA1
- 09年06月09日 アルターナティブスプライシングとDNAダメージ、CTCFとInk4a、miRNA145とstem cellなど
- 09年05月26日 Rtr1
- 09年05月26日 Histone modification at human enhancers reflect global cell-type-specific gene expression
- 09年05月26日 A Role of DNA-PK for the Metabolic Gene Regulation in Response to Insulin
- 09年05月26日 発生途上のインターフェロンγ遺伝子座におていコヒーシンはシスの相互作用の制御にかかわる
- 09年05月25日 DNA-PK, ポリメレースII、コヒーシン
- 09年05月13日 ヒストンH2A
- 09年05月13日 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L (HnRNP-L) is a subunit of human KMT3a/Set2 complex required for H3 lys36 trimethylation activity in vivo.
- 09年05月13日 ヒストンH2AXは低酸素による血管新生に必須である.
- 09年05月13日 連続的なユビキチン化によるゲノム修復
- 09年05月13日 γH2AX and cancer
- 09年05月12日 H2AXとがん、血管新生、クロモゾーム修復
- 09年04月23日 WSTFによるTyr142のリン酸化
- 09年04月22日 Evidence for a Bigenic Chromatin Subdomain in Regulation of the Fetal-to-Adult Hemoglobin
- 09年04月22日 Ezh2 Orchestrates Gene Expression for the Stepwise Differentiation of Tissue-Specific Stem Cells
- 09年04月22日 Comprehensive Characterization of Genes Required for Protein Folding in the Endoplasmic Reticulum.
- 09年04月22日 Tyrosine dephosphorylation of H2AX modulates apoptosis and survival decisions
- 09年04月21日 エピゲノム勉強会:論文一覧
- 09年04月07日 H3K9メチル化抗体の比較と作製について
- 09年04月07日 NEAT1 RNAのparaspeckleの形成における役割
- 09年04月07日 non-coding RNAのPcG/TrxGリクルートなどの制御への関与
- 09年04月07日 PWWPドメイン蛋白によるset-9でのH4K20メチル化の制御
- 09年04月06日 ヒストンメチル化とその制御
- 09年03月24日 要旨(3)G9A阻害薬の解析
- 09年03月24日 要旨(2)APCと局在RNA
- 09年03月24日 酵母遺伝子調節ネットワークの複雑性の解析
- 09年03月23日 ゲノムワイド・エピゲノム解析
- 09年03月17日 Origins and Mechanisms of miRNAs and siRNAs
- 09年03月17日 スプライセオソームのダイナミクスについて
- 09年03月16日 エピゲノム勉強会RNA特集
- 09年03月11日 ユビキチンを介したシグナル伝達について
- 09年03月11日 HIF1結合部位の統合的解析とヒストンメチル化維持のための転写活性化機構
- 09年03月10日 エピゲノム勉強会
- 09年03月02日 ヒストンメチル化
- 09年02月26日 ヌクレオソームとは、chip-seq関係の進展
- 09年02月17日 MLL1の結晶構造、GSK3阻害薬でのMLL阻害、新規p53標的遺伝子PHLDA3の同定(Cell)
- 09年02月17日 MLLの神経作用(追加解説)
- 09年02月10日 ヒストン脱メチル酵素JMJD(JHDM)とH4K4メチル化のMLL
- 09年02月09日 Aire's Partners in the Molecular Control of Immunological Tolerance
- 09年02月03日 K36、SIRT6とNFKB 、クロマチンコード
- 08年12月22日 miRNAとES細胞のコア転写サーキットの関係
- 08年12月10日 転写のソレクサ解析新論文
- 08年10月31日 EZH2 (第3回)
- 08年10月02日 癌と細胞老化とエピゲノム変化
- 08年09月18日 要旨3
- 08年09月18日 MLLの複合体
- 08年09月18日 要旨2
- 08年09月03日 MLL (2)
- 08年09月03日 MLLと細胞周期
- 08年08月28日 脱メチル化酵素とトライソラックス蛋白(MLL)の複合体の機能
- 08年07月16日 PR-SET7の欠損モデルを使った機能解析をショウジョウバエとほ乳類で行った論文3報
- 08年07月09日 Polycomb silencing mechanisms and the management of genomic programmes
- 08年06月27日 PR-SET7の欠損モデルを使った機能解析をショウジョウバエとほ乳類で行った論文3報
- 08年06月27日 SETDB1はKAP1を介してH3K9をメチル化し、その結果HP1がリクルートされて遺伝子が不活性化される
- 08年06月19日 Position effect variegation ant the genetic dissection of chromatin regulation in Drosophila
- 08年06月13日 SUMOによる遺伝子サイレンシング複合体
- 08年06月06日 コレプレッサーの分子内SUMO化とsetdb1の動員
- 08年05月30日 転写の調節にはRNA polymerase (Pol II)のリクルートだけではなく、転写開始点やもう少し下流の特定の部位にPol IIを止めるメカニズムが関与している
- 08年05月29日 Chromosomal Soap Opera Cell (21 Mar. 2008号)の表紙を飾った論文。 Nuclear Receptor-Enhanced Transcription Requires Motor- and LSD1-Dependent Gene Networking in Interchromatin Granules.
- 08年05月29日 読めばわかる Solexaを用いてRNA-Seq (*1)を行った論文がCell, Science, Natureに1本ずつ出揃いましたところで
- 08年05月22日 Epigenetic Working Memory? Monoubiquitinated H2B is associated with the transcribed region of highly expressed genes in human cells. -Minsky et al. Nature Cell Biology 2008 Apr;10(4):483-8. を読んで
- 08年05月16日 酵母のヘテロクロマチンにはRNA Polymerase IIが無いわけではなくその伸長反応が早期に停止され転写産物が積極的に分解をうけるメカニズムがあって転写産物の生成が抑えられている。
- 08年05月15日 第2回エピジェネティクス研究会年会(5月9~10日)
- 08年05月14日 CSH Genome & Biology会議(5月6~10日)
- 08年04月24日 パースペクティブ ポリメレースのポージングでの転写制御
- 08年04月18日 総説 ヒストンユビキチン化は遺伝子活性化のトリッガーである
- 08年04月18日 パースペクティブ Gene Regulation in the Third Dimension Job Dekker Science 2008 319 1793-4
- 08年04月10日 クロマチンとクローバー Dynamic interactions between the promoter and terminator regions of the mammalian BRCA1 gene. -Tan-Wong et al. PNAS, 2008 Apr 1;105(13):5160-5. を読んで
- 08年03月17日 Transcriptional "前ならえ"