2012年4月12日
Nuclear Matrix Factor hnRNP U/SAF-A Exerts a Global Control of lternative Splicing by Regulating U2 snRNP Maturation
Nuclear Matrix Factor hnRNP U/SAF-A Exerts a Global Control of lternative Splicing by Regulating U2 snRNP Maturation.
Xiao R, Tang P, Yang B, Huang J, Zhou Y, Shao C, Li H, Sun H, Zhang Y,
Fu XD.
SourceState Key Laboratory of Virology, College of Life Sciences, Wuhan
University, Wuhan, Hubei 430072, China.
Mol Cell. 2012 Mar 9;45(5):656-68. Epub 2012 Feb 9.
CLIPseqによりhnRNP UがintronやsnRNAなどのnon-coding
RNAに多く結合しており、U2 snRNPのmaturationを制御し
ていることがわかった(hnRNP UのノックダウンでU2 snRNP
のmaturation form, 17S U2 snRNPが増加する）。さらに、
hnUNP Uをノックダウンすると、snRNPのmaturationを促進
する場であるCajar bodyが増加することがわかった。
hnRNP Uをノックダウンした細胞を用いたRNA seqの結果、
多くの遺伝子においてオルタナティブスプライシングが
inclusion, skippingともに変化することがわかり、U2 snRNP
の増大によるindirectなものであると考えられた。カセットエ
クソン（オルタナティブスプライシングでスキップされるエク
ソン）と両側のエクソンでのsplice site strenghtと、exon
inclusion, skippingの割合を比較すると、alternative 5'
splice sitesの強度と相関があった。
（モデル）alternative 5' splice sitesが弱い場合、alternative
3' splice siteのrecognitionも低下するので、exon definition
も弱くなりskipが起こる。一方、 alternative 5' splice sitesが
特に弱くない場合はU2 snRNPの増大によりrecognitionさ
れやすくなりinclutionsされる。
（担当：堀内）