2011年10月13日

CTCF-promoted RNA polymerase II pausing links DNA methylation to splicing

CTCF-promoted RNA polymerase II pausing links DNA methylation to splicing

Shukla S, Kavak E, Gregory M, Imashimizu M, Shutinoski B, Kashlev M, Oberdoerffer P, Sandberg R, Oberdoerffer S.

Nature. 2011 Oct 2. doi: 10.1038/nature10442.

CTCFは"intergenic activity"（インスレータとしての機能）についてよく研究
されている分子であるが、多くのChIP-seqデータベースから遺伝子間のみな
らず遺伝子内に結合することも示されている。このCTCFの遺伝子内結合によ
る"intragenic activity"については今まで報告がなく不明であった。本論文では、
exon上のCTCF結合によるintragenic activityとしてalternative splicing への影響
を報告している。
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ChIP-seq database showed CTCF known as an insulator bound to intragenic
region. However, intragenic activity of CTCF remains unclear. This paper
suggested CTCF binding on exon linked to alternative splicing of pre-mRNA.

(担当：末弘)