情報解析・バイオインフォーマティクス

　ESCUTで推進される、遺伝子発現解析、染色体変異解析、ChIP on chip解析から生まれる大量の実験データや解析結果データを、 以下のような計算機リソースを活用して解析・データベース化している。



PCクラスター： 40 node (80 CPU) による並列計算
　スケーラビリティのあるPCクラスタによる計算リソースとして活用している。 本システムでは主に

• 電子文献からの蛋白質相互作用抽出と、網羅的な蛋白質相互作用解析システム
• SNPsタイピングアレイを用いた、ヒトコピー数多型(CNV; Copy Number Variation)解析を行っている。

計算サーバ： Opteron 8-wayサーバ＋ディスクアレイ
　大量に蓄積する遺伝子発現データやコピー数解析データを統合的・系統的に解析するために、大容量のメモリ領域(64GB)とディスク容量(20TB)を もち、長時間の計算に耐え得る計算機が必要である。 　主に、遺伝子発現データベースや多数検体の総当たり解析などに用いている。

データサーバシステム： JCS StorageServer システム
　全ゲノム領域での遺伝子発現、SNPsタイピング用DNAマイクロアレイによる包括的アレル別コピー数解析を統合的・系統的に推進するためには、実験 データ及び解析結果データを、大容量、耐障害性、可用性に優れた長期継続的な維持が可能なデータサーバに保管することが必要である。 以下の機能をもつデータサーバシステムを導入している。

• 大容量（20TB）ディスクアレイを搭載可能
• 耐障害性の高いRAID6対応 ディスクアレイ
• データバックアップの為の非同期型の複製ソフトウェアに対応
• Online Roaming機能を実装